Descrizione
Il kit NGS DeepChek® Assay Whole Genome BKV Genotyping v1 è un dispositivo RUO che utilizza la tecnologia PCR per amplificare l’intero genoma di BKV, allo scopo di identificare il genotipo e le mutazioni del virus.
Gli ampliconi prodotti con questo kit possono essere utilizzati per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) e tramite un software di analisi, è possibile identificare le mutazioni presenti nel genoma BKV e confrontarle con le banche dati di riferimento.
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Caratteristiche rilevanti
- Permette il sequenziamento dell’intero genoma di BKV
- Compatibile con molti sistemi di estrazione e matrici differenti
- Sono richiesti solo 10uL di DNA estratto
Contenuto del kit
Il kit contiene:
- Il dispositivo include tutti i reagenti necessari per eseguire lo step di amplificazione
Approfondimento
Il poliomavirus umano BK (BKV) appartiene alla famiglia dei Polyomaviridae ed è largamente diffuso nella popolazione fino a raggiungere il 90% di sieroconversione negli adulti, nei quali gli anticorpi persistono per tutta la vita. L’infezione primaria viene acquisita in età infantile ed è generalmente asintomatica.
Dopo la prima infezione, BKV rimane latente nelle cellule del tratto urogenitale ed in altri siti (uretere, cervello, milza, linfociti B) e saltuariamente si riattiva. La riattivazione (spesso asintomatica) è stata documentata nelle donne in gravidanza (5-10%) e nei soggetti immunodepressi. In questi soggetti l’infezione da BKV è stata associata a diverse patologie, tra le quali cistite emorragica, nefrite interstiziale, stenosi ureterali, vasculopatie disseminate, carcinoma della vescica e quadri di multi-organ failure.
La nefropatia interstiziale associata all’infezione da BKV (BKVAN) può causare la disfunzione renale dopo trapianto di rene e riguarda circa il 1-10% dei riceventi.
Nei riceventi un trapianto allogenico di midollo osseo il problema serio causato da BKV è la cistite emorragica con inizio ritardato (HC) che si presenta nel 20-30% dei casi. La viruria precede, accompagna la cistite e può prolungarsi dopo la sua risoluzione.
Il sequenziamento dell’intero genoma del virus BKV rende possibile discriminarne il genotipo e comprendere meglio le dinamiche di infezione per l’elaborazione di strategie terapeutiche mirate. Analizzarne il genoma permette di identificare le mutazioni specifiche che possono influenzare la sua virulenza e la resistenza ai trattamenti.
Informazioni per gli ordini
| Codice | Prodotto | Confezionamento |
|---|---|---|
| 20-189A24 | DeepChek® Assay Whole Genome BKV Genotyping V1 Kit | 24 test |