DeepChek^® Assay CORE Genotyping Kit

Descrizione

Il kit NGS e Sanger DeepChek^® Assay NS5B Genotyping and Drug Resistance v4 è un dispositivo RUO che utilizza la tecnologia RT-PCR per amplificare la regione CORE del virus dell’Epatite C (HCV) a partire da RNA estratto da plasma/siero.

L’amplicone prodotto con questo kit può essere utilizzato per il sequenziamento di nuova generazione o sequenziamento Sanger, e tramite un software di analisi, è possibile identificare con precisione il genotipo e sottotipo di HCV.

Caratteristiche rilevanti

• Sequenziamento della regione CORE di HCV per identificarne il genotipo e sottotipo del virus con maggiore accuratezza
• Compatibile con molti sistemi di estrazione e matrici differenti.
• Può essere usato per il sequenziamento Sanger come per il sequenziamento NGS
• Sono richiesti 10 µL di RNA estratto

Contenuto del kit

• Il dispositivo include tutti i reagenti necessari per eseguire lo step di retrotrascrizione ed amplificazione

Approfondimento

Il virus dell’Epatite C (HCV) appartiene alla famiglia dei Flaviviridae e possiede un genoma caratterizzato da un elevato grado di variabilità. Sulla base di indagini filogenetiche e della variabilità della sequenza genomica, sono stati identificati 7 principali genotipi di HCV. I diversi genotipi differiscono nella sequenza nucleotidica per circa il 30% l’uno dall’altro. Ciascun genotipo comprende a sua volta diversi sottotipi contrassegnati dalle lettere minuscole dell’alfabeto. Ciascun sottotipo differisce a livello nucleotidico di circa il 20% rispetto ad altri membri dello stesso genotipo.

L’HCV è la principale causa di epatite cronica, cirrosi e carcinoma epatocellulare in tutto il mondo. L’infezione da HCV può essere asintomatica o presentare sintomi come affaticamento, ittero, dolore addominale, nausea e vomito. La trasmissione avviene principalmente attraverso il contatto con sangue infetto, spesso tramite aghi contaminati o trasfusioni di sangue non sicure.

La diagnosi di HCV viene confermata attraverso test molecolari che identificano l’RNA del virus. Una diagnosi rapida e accurata è cruciale per la gestione delle infezioni da HCV e per prevenire le complicazioni.

Il sequenziamento della regione CORE di HCV aiuta ad identificare con accuratezza il genotipo e il sottotipo del virus, consentendo di individuare il miglior regime terapeutico.

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