Descrizione
Il kit NGS e Sanger DeepChek® Assay Integrase Genotyping and Drug Resistance v1 è un dispositivo CE-IVD che utilizza la tecnologia RT-PCR per amplificare la regione dell’integrasi (INT) del virus dell’immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) a partire da RNA estratto da campioni di plasma, siero o sangue intero.
Gli ampliconi prodotti con questo kit possono essere utilizzati per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) o il sequenziamento Sanger, e tramite un software di analisi, è possibile genotipizzare il virus dell’HIV-1, identificare le mutazioni presenti nella regione INT in grado di conferire resistenza agli antivirali ed ottenere informazioni sulla suscettibilità agli inibitori dell’Integrasi.
Caratteristiche rilevanti
- Sequenziamento della regione INT di HIV-1 per identificare
- mutazioni associate alla resistenza ai farmaci inibitori di INT.
- Sottotipo HIV
- Mutazioni APOBEC
- Compatibile con molti sistemi di estrazione e matrici differenti.
- Può essere usato per il sequenziamento Sanger come per il sequenziamento NGS
- Sono richiesti solo 12,5 µL di RNA estratto.
- Può essere utilizzato anche per valutare DNA provirale
- CE-IVD
Contenuto del kit
- Il dispositivo include tutti i reagenti necessari per eseguire lo step di retrotrascrizione ed amplificazione
Approfondimento
Il virus dell’immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) è responsabile dell’infezione da HIV che può portare alla sindrome da immunodeficienza acquisita (AIDS).
HIV-1 possiede un genoma a RNA e si trasmette principalmente tramite contatto con sangue infetto, liquidi corporei o da madre a figlio durante la gravidanza, il parto o l’allattamento.
Il trattamento dell’HIV-1 si basa su terapie antiretrovirali (ART) che combinano più farmaci per ridurre la carica virale e migliorare la qualità della vita dei pazienti.
Tuttavia, la resistenza ai farmaci antiretrovirali è un problema crescente e può emergere a causa di mutazioni in vari geni e regioni del genoma virale:
- Trascrittasi inversa (RT):
- inibitori della trascrittasi inversa nucleosidici (NRTI)
- inibitori della trascrittasi inversa non nucleosidici (NNRTI)
- Proteasi (PR):
- inibitori della proteasi.
- Integrasi (INT):
- inibitori dell’integrasi.
- Glicoproteina 41 (GP41):
- inibitori della fusione.
- Glicoproteina 120 (GP120):
- inibitori dell’entrata.
- Proteine GAG (GAG):
- inibitori del Capside
Mutazioni nel DNA provirale di HIV-1, integrate nel genoma dell’ospite, possono anche conferire resistenza ai farmaci e complicare ulteriormente il trattamento. Inoltre, le mutazioni APOBEC, introdotte dall’enzima umano APOBEC3G durante la replicazione virale, possono provocare modifiche nel genoma di HIV-1, contribuendo alla diversità genetica del virus e potenzialmente alla resistenza ai farmaci.
Il sequenziamento INT dell’HIV-1 permette non solo di identificare il sottotipo ma anche di identificare le mutazioni responsabili delle resistenze agli inibitori dell’Integrasi, permettendo così di identificare la terapia antivirale adatta.
Informazioni per gli ordini
| Codice | Prodotto | VERSIONE | Confezionamento | CERTIFICAZIONE |
|---|---|---|---|---|
| 20-122A24 | DeepChek® Assay Integrase Genotyping and Drug Resistance Kit | V1.x | 24 test | CE-IVD |
| 20-102C24 | DeepChek® Assay Integrase Genotyping and Drug Resistance Kit | V3.x | 24 test | RUO |
| 20-102C96 | DeepChek® Assay Integrase Genotyping and Drug Resistance Kit | V3.x | 96 test | RUO |
| 20-126A24 | INTEGRASE SEQUENCING In associazione con il cod. 20-122A24 per il sequenziamento Sanger | V1.x | 24 test | CE-IVD |