DeepChek^® Assay NS3 Genotyping and Drug Resistance v1 Kit

Descrizione

Il kit NGS e Sanger DeepChek® Assay NS3 Genotyping and Drug Resistance v1 è un dispositivo RUO che utilizza la tecnologia RT-PCR per amplificare la regione NS3 del virus dell’Epatite C (HCV) a partire da RNA estratto da plasma/siero.

L’amplicone prodotto con questo kit può essere utilizzato per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) o sequenziamento Sanger, e tramite un software di analisi, è possibile identificare il genotipo di HCV e le mutazioni in grado di conferire resistenza agli Inibitori di NS3.

Caratteristiche rilevanti

• Sequenziamento della regione NS3 di HCV per identificare
  • mutazioni associate alla resistenza ai farmaci inibitori di NS3.
  • Genotipo di HCV
• Compatibile con molti sistemi di estrazione e matrici differenti.
• Può essere usato per il sequenziamento Sanger come per il sequenziamento NGS
• Sono richiesti solo 10 µL di RNA estratto

Contenuto del kit

• Il dispositivo include tutti i reagenti necessari per eseguire lo step di retrotrascrizione ed amplificazione

Approfondimento

Il virus dell’Epatite C (HCV) appartiene alla famiglia dei Flaviviridae e possiede un genoma caratterizzato da un elevato grado di variabilità. Sulla base di indagini filogenetiche e della variabilità della sequenza genomica, sono stati identificati 7 principali genotipi di HCV. I diversi genotipi differiscono nella sequenza nucleotidica per circa il 30% l’uno dall’altro. Ciascun genotipo comprende a sua volta diversi sottotipi contrassegnati dalle lettere minuscole dell’alfabeto. Ciascun sottotipo differisce a livello nucleotidico di circa il 20% rispetto ad altri membri dello stesso genotipo.

L’HCV è la principale causa di epatite cronica, cirrosi e carcinoma epatocellulare in tutto il mondo. L’infezione da HCV può essere asintomatica o presentare sintomi come affaticamento, ittero, dolore addominale, nausea e vomito. La trasmissione avviene principalmente attraverso il contatto con sangue infetto, spesso tramite aghi contaminati o trasfusioni di sangue non sicure.

La diagnosi di HCV viene confermata attraverso test molecolari che identificano l’RNA del virus. Una diagnosi rapida e accurata è cruciale per la gestione delle infezioni da HCV e per prevenire le complicazioni. I farmaci antivirali possono ridurre la carica virale e migliorare i tassi di guarigione, ma la resistenza ai farmaci è un problema crescente.

La resistenza ai farmaci antivirali può emergere a causa di mutazioni in varie regioni del genoma virale, in grado di conferire resistenza alle principali classi di antivirali tra cui troviamo inibitori di NS5A, inibitori di NS5B ed inibitori di NS3.

Il sequenziamento delle regioni NS53 dell’HCV permette non solo di identificare il genotipo ma anche di identificare alcune delle mutazioni responsabili delle resistenze ai farmaci antivirali attualmente disponibili, aiutando a sviluppare strategie terapeutiche mirate..

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