Descrizione
Il kit NGS e Sanger DeepChek® Assay V3 LOOP / TROPISM v1 è un dispositivo RUO che utilizza la tecnologia RT-PCR per amplificare la regione V3 Loop del virus dell’immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) a partire da RNA estratto da campioni di plasma, siero o sangue intero.
Gli ampliconi prodotti con questo kit possono essere utilizzati per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) o il sequenziamento Sanger, e tramite un software di analisi, è possibile definire il tropismo di HIV-1.
Caratteristiche rilevanti
- Sequenziamento della regione V3 Loop per identificare il Tropismo di HIV-1
- Compatibile con molti sistemi di estrazione e matrici differenti.
- Può essere usato per il sequenziamento Sanger come per il sequenziamento NGS
- Sono richiesti solo 10 µL di RNA estratto.
- Può essere utilizzato anche per valutare DNA provirale
Contenuto del kit
- Il dispositivo include tutti i reagenti necessari per eseguire lo step di retrotrascrizione ed amplificazione
Approfondimento
Il virus dell’immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) è responsabile dell’infezione da HIV che può portare alla sindrome da immunodeficienza acquisita (AIDS).
HIV-1 possiede un genoma a RNA e si trasmette principalmente tramite contatto con sangue infetto, liquidi corporei o da madre a figlio durante la gravidanza, il parto o l’allattamento.
Il trattamento dell’HIV-1 si basa su terapie antiretrovirali (ART) che combinano più farmaci per ridurre la carica virale e migliorare la qualità della vita dei pazienti.
Tuttavia, la resistenza ai farmaci antiretrovirali è un problema crescente e può emergere a causa di mutazioni in vari geni e regioni del genoma virale:
- Trascrittasi inversa (RT):
- inibitori della trascrittasi inversa nucleosidici (NRTI)
- inibitori della trascrittasi inversa non nucleosidici (NNRTI)
- Proteasi (PR):
- inibitori della proteasi.
- Integrasi (INT):
- inibitori dell’integrasi.
- Glicoproteina 41 (GP41):
- inibitori della fusione.
- Glicoproteina 120 (GP120):
- inibitori dell’entrata.
- Proteine GAG (GAG):
- inibitori del Capside
Mutazioni nel DNA provirale di HIV-1, integrate nel genoma dell’ospite, possono anche conferire resistenza ai farmaci e complicare ulteriormente il trattamento. Inoltre, le mutazioni APOBEC, introdotte dall’enzima umano APOBEC3G durante la replicazione virale, possono provocare modifiche nel genoma di HIV-1, contribuendo alla diversità genetica del virus e potenzialmente alla resistenza ai farmaci.
Il sequenziamento della regione V3 Loop di HIV-1 permette di identificare il tropismo del virus.
Informazioni per gli ordini
| Codice | Prodotto | Confezionamento |
|---|---|---|
| 20-103A24 | DeepChek® Assay V3 LOOP / TROPISM v1 Kit | 24 test |